چگونه محققان آفریقای جنوبی نوع Omicron کووید را شناسایی کردند

اطلاعات کمی در مورد نوع Omicron که برای اولین بار در آفریقای جنوبی کشف شد، وجود دارد، اما ماهیت جهش‌های آن و ظهور به ظاهر سریع آن، دولت‌های سراسر جهان را نگران کرده است. دانشمندان در حال حاضر در تلاش هستند تا رمزگشایی کنند که نسخه جدید چقدر مسری و کشنده است - و تا چه حد می تواند از هر یک از محافظت های ارائه شده توسط نسخه های موجود جلوگیری کند. کووید-19 واکسن در همین حال، ایالات متحده، بریتانیا و بسیاری از اروپا ممنوعیت سفر را در آفریقای جنوبی اعمال کرده اند. ژاپن، اسرائیل و مراکش همه بازدیدکنندگان خارجی را ممنوع کرده اند.

اخیراً با تولیو دی اولیویرا، مدیر مرکز پاسخگویی به بیماری همه گیر و نوآوری در دانشگاه استلنبوش، آفریقای جنوبی تلفنی صحبت کردم. دی اولیویرا و تیمش دانشمندانی بودند که برای اولین بار سازمان بهداشت جهانی و سایر مقامات را از نسخه جدید آگاه کردند. در طول مکالمه ما، که برای طولانی بودن و وضوح ویرایش شد، در مورد اینکه چگونه برای اولین بار از وجود Omicron مطلع شد، چگونه ممنوعیت سفر می تواند بر همکاری بین المللی آینده تأثیر بگذارد، و چرا سطح واکسیناسیون در آفریقای جنوبی نسبت به کشورهای ثروتمند آفریقای جنوبی عقب است، بحث کردیم.

اولین بار چه زمانی وجود این گزینه جدید را احساس کردید؟

من محقق و رهبر اصلی شبکه مشاهده ژنومی آفریقای جنوبی هستم که شامل هفت مرکز ژنومی توزیع شده در سراسر کشور است. افزایش موارد در استان گوتنگ مشاهده شد. این فقط یک افزایش کوچک بود - هر روز حدود دویست مورد در سراسر کشور داشتیم. اما آنها شروع به رشد کردند، بنابراین ما با شبکه خود ملاقات کردیم و گفتیم که باید بفهمیم چرا آنها در استانی که بزرگترین موج قبلی عفونت های دلتا را داشت، رشد می کردند. این گزینه در گوتنگ بسیار شدید بود و بین شصت تا هشتاد درصد افراد مبتلا به آن بودند کوویدبا توجه به آزمایشات سرولوژیکی

بنابراین در روز جمعه، 19 نوامبر، تصمیم گرفتیم که باید مشاهدات ژنومی را در گاوتنگ افزایش دهیم. و تا سه شنبه گذشته، ما از یکی از اعضای شبکه خود شنیدیم که یک آزمایشگاه خصوصی، آزمایشگاه Lancet، شش ژنوم یک ویروس بسیار جهش یافته را ارسال کرده است. و وقتی به ژنوم ها نگاه کردیم، کاملاً نگران شدیم زیرا آنها نقص یکی از کاوشگرها را در آزمایش PCR پیدا کردند. ما به تمام داده های ملی برگشتیم و متوجه شدیم که این شکست در بسیاری از آزمایشات PCR افزایش یافته است. آزمایش‌های PCR همچنان کار می‌کردند، زیرا سه پروب داشتند، اما یکی از آنها شکست خورد. و سپس شش ژنوم را مورد بحث قرار دادیم. ما شگفت زده شدیم، اما باید مطمئن می شدیم که این فقط یک زنجیره انتقال کوچک نیست. گسترده بود. بنابراین سه شنبه گذشته این جلسه را داشتیم و من از آزمایشگاه های دیگر نمونه درخواست کردم.

روز سه‌شنبه وقتی متوجه این جهش‌یافته شدم، با مدیرکل بهداشت تماس گرفتم و او به من گفت تا سی و شش ساعت دیگر با من و وزیر بهداشت ملاقاتی خواهد داشت. بنابراین ما سی و شش ساعت فرصت داشتیم تا واقعی بودن آن را تأیید کنیم. در همان زمان به سازمان بهداشت جهانی نامه نوشتم زیرا در کارگروه تکامل ویروس ها هستم. صبح روز بعد، بیش از صد نمونه از بیش از 30 کلینیک در گاوتنگ دریافت کردیم و شروع به ژنوتیپ و تجزیه و تحلیل جهش ویروس کردیم. ما همه داده‌ها را به کاهش PCR، افزایش موارد در آفریقای جنوبی و نرخ مثبت مرتبط کردیم و سپس متوجه شدیم که این می‌تواند یک گزینه بسیار ناگهانی باشد. تا صبح پنجشنبه، همه ژنوم ها را برگردانده بودیم، و همه آنها یک گزینه بودند - حدود صد نمونه تصادفی از سراسر گوتنگ، که در آن آزمایش مشابه با شکست مواجه شد. در آن زمان، من به اندازه کافی مطمئن بودم که نتایج را به وزیر بهداشت، علوم و نوآوری ارائه کنم، او نتایج را کاملا جدی گرفت و از من خواست تا در ساعت 10:30 با رئیس جمهور سیریل رامافوزا صحبت کنم. صبحکه من انجام دادم

آن گفتگو چگونه بود؟

او نتایج را بررسی کرد و نظرات وزیران را دریافت کرد و در این زمان بود که اولین گزارش ها از گزینه جدید احتمالی از آفریقای جنوبی در رسانه ها ظاهر شد. بنابراین رئیس جمهور پاسخ ساده ای داد: بهتر است در قالب شفاف ارائه شود، زیرا ما شواهد کافی داریم. و سپس از وزیر بهداشت خواست تا ظهر یک نشست خبری تشکیل دهد. بنابراین از لحظه ای که گزینه را کشف کردیم و سپس وجود آن را در صدها نمونه در سراسر استان تایید کردیم تا زمانی که آن را به وزرای کلیدی معرفی کردیم و با رئیس جمهور صحبت کردیم و آن را علنی اعلام کردیم، حدود سی و شش ساعت بود.

در حال حاضر قصد دارید در مورد نسخه جدید چه چیزی یاد بگیرید؟

چهارشنبه گذشته، ما تمام آن زمان را صرف سازماندهی و تجزیه و تحلیل داده ها کردیم، اما اولین گفتگوی خود را با WHO نیز انجام دادیم، و همچنین داده ها را با سه یا پنج تن از بهترین زیست شناسان تکاملی در جهان، در بریتانیا و در بریتانیا در میان گذاشتیم. ایالات متحده. همانطور که ما در مورد داده ها در روز چهارشنبه بحث کردیم، همه آنها نگران تعداد و مکان جهش بودند. روز جمعه صدها ژنوم و داده را برای آزمایش دیگر منتشر کردیم و جلسه ای با کارگروه فنی سازمان جهانی بهداشت در مورد تکامل ویروس داشتیم. این گروه تصمیم گرفت آن را به عنوان یک "نگرانی" طبقه بندی کند، که بسیار غیرعادی است زیرا فکر می کردیم جهش های نگران کننده و داده های اپیدمیولوژیک زیادی وجود دارد. این شامل داده هایی در مورد عفونت مجدد است که نشان می دهد این گزینه به طور بالقوه می تواند افراد را آلوده کند. بنابراین در روز جمعه، WHO بیانیه مطبوعاتی خود را ارسال کرد و نامی یونانی برای این گزینه گذاشت و تاکید کرد که این "نگرانی جهان" است.

میشه در موردش صحبت کنید کووید وضعیت آفریقای جنوبی قبل از آن؟

من آن را به دو دوره تقسیم می کنم. وضعیت ماه گذشته با حداقل عفونت بود، حدود دویست عفونت در روز با تست مثبت زیر یک درصد، یعنی بیش از اندازه کافی آزمایش داشتیم. برخی از دانشمندان فکر می کردند که ما موج چهارم نخواهیم داشت زیرا سطح بالایی از مصونیت جمعیتی داریم. بنابراین در این مرحله در ماه گذشته، ما فکر می کردیم که همین است. دیگر مشکلی نخواهیم داشت کووید. مردم آرام بودند و فکر می کردند که می توانیم به زندگی عادی برگردیم. حتی آزمایشگاه من سایر پاتوژن ها و ویروس ها را توالی یابی کرد زیرا این کاری است که ما انجام می دهیم.

بنابراین ما بسیار شگفت زده شدیم که گزینه ای را برای حضور در مکانی با بالاترین مصونیت جمعیت در کشور دیدیم. من فکر می کنم این یکی از چیزهایی است که دنیا متوجه نمی شود. برخی از افراد سعی کرده اند این گزینه را به دلیل تردید در مورد واکسن سرزنش کنند. ما با آن مشکل داریم، اگرچه به طور بالقوه مشکلی به بزرگی ایالات متحده نیست. اما مردم واقعا فکر می کردند که ما از جنگل بیرون آمده ایم. متأسفانه، نسخه جدید ظاهر شده است و به نظر می رسد واضح است که می تواند دوباره مردم را آلوده کند، که به طور بالقوه آخرین میخ در تابوت مصونیت گله ای است که یکی از روسای جمهور شما در مورد آن صحبت می کند.